A inativação do cromossoma X (XCI) equilibra os níveis de expressão de genes do cromossoma X entre mulheres (XX) e homens (XY), silenciando transcricionalmente um dos cromossomas X. Em células estaminais pluripotentes induzidas humanas (hiPSCs) femininas, pode ocorrer a erosão da XCI, um processo caraterizado pela perda de RNA XIST e subsequente reativação parcial de genes do cromossoma X inativo (Xi). Este fenómeno, muitas vezes negligenciado, tem consequências significativas para as aplicações de células estaminais.

Num novo estudo publicado na Stem Cell Reports, investigadores do Stem Cell Engineering Research Group (SCERG-iBB) demonstraram que a erosão da XCI em hiPSCs femininas é frequente e heterogénea, levando à reativação de múltiplos genes ligados ao cromossoma X. Estes genes reativados estão localizados principalmente no braço curto do cromossoma X, frequentemente perto de genes conhecidos por escaparem à inativação do cromossoma X e dentro de domínios enriquecidos em H3K27me3, com a reativação ligada à redução da metilação do DNA do promotor. Uma observação importante foi que mesmo os genes que escapam à XCI mostram uma expressão aumentada do Xi durante a erosão, destacando o papel crucial do XIST na regulação da dose para estes genes. Importa ainda referir que esta erosão não afetou significativamente os níveis globais de metilação ou regiões sujeitas a imprinting e persistiu ao longo da diferenciação. Estas descobertas sublinham a necessidade de uma maior consciencialização sobre as implicações da erosão da XCI para a investigação com células estaminais e aplicações clínicas.

O estudo, que teve como primeiros autores Ana C. Raposo e Paulo Caldas, foi realizado sob a supervisão de Simão T. da Rocha (Stem Cell Epigenetics Lab) em colaboração com o Computational Multi-Omics lab (UCIBIO-NOVA-FCT) e grupos no Reino Unido e na Austrália. Ver mais.